Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700067P10RikG3X8U2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700067P10RikG3X8U2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms