Protein–RNA interactions for Protein: G3UXR8

Gm20532, Predicted gene 20532, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20532G3UXR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20532G3UXR8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20532G3UXR8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms