Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
5830473C10RikF8VQ07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms