Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arid4aF8VPQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid4aF8VPQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms