Protein–RNA interactions for Protein: F6WY25

Gm10271, Predicted gene 10271, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10271F6WY25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10271F6WY25 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10271F6WY25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms