Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC067074F6RXI4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms