Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc146E9Q9F7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc146E9Q9F7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms