Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col22a1E9Q7P1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms