Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp31E9Q6Y8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp31E9Q6Y8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms