Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms