Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc1E9Q5K9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms