Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb9E9Q5G2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb9E9Q5G2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms