Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn2r48E9Q5D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms