Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DspE9Q557 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DspE9Q557 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms