Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
8030474K03RikE9Q4Y8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms