Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ccdc71lE9Q4T4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ccdc71lE9Q4T4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc71lE9Q4T4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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