Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pde8bE9Q4S1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde8bE9Q4S1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde8bE9Q4S1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms