Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ApobE9Q414 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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