Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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