Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Irf2bp2E9Q1P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irf2bp2E9Q1P8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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