Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5cE9Q1F5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5cE9Q1F5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5cE9Q1F5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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