Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms