Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdr1E9Q0B4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms