Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms