Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms