Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph10bE9PYQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms