Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbf2E9PXF8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf2E9PXF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbf2E9PXF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms