Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc175E9PVB3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms