Protein–RNA interactions for Protein: E9PV59

Inafm1, InaF motif-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inafm1E9PV59 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Inafm1E9PV59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Inafm1E9PV59 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inafm1E9PV59 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Inafm1E9PV59 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms