Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp839E9PUU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp839E9PUU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp839E9PUU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms