Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BC035044E0CXF8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035044E0CXF8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms