Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc6D3YZP9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc6D3YZP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc6D3YZP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc6D3YZP9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms