Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo5D3YW29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo5D3YW29 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms