Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17333C6EQI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17333C6EQI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17333C6EQI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17333C6EQI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17333C6EQI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17333C6EQI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm17333C6EQI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm17333C6EQI3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17333C6EQI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17333C6EQI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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