Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cttnbp2B9EJA2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms