Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mterf1bB9EJ57 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mterf1bB9EJ57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms