Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cspp1B2RX88 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms