Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms