Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm438B1ASB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms