Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skint5A7XUY5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skint5A7XUY5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms