Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M5A7VMS3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M5A7VMS3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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