Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms