Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp8b5A3FIN4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp8b5A3FIN4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp8b5A3FIN4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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