Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Palm3A2TJV2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palm3A2TJV2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Palm3A2TJV2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms