Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms