Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xlr4aA2BI40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xlr4aA2BI40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xlr4aA2BI40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Xlr4aA2BI40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Xlr4aA2BI40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xlr4aA2BI40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xlr4aA2BI40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms