Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Upf2A2AT37 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms