Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Patl2A2ARM1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms