Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syndig1A2ANU3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syndig1A2ANU3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms