Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FocadA2AKG8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FocadA2AKG8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FocadA2AKG8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms